| Product | 50 nmol scale | 200 nmol scale | 1 umol scale | 2 umol scale | 10 umol scale | 15 umol scale |
| Catalog No. | 26-6400-05 | 26-6400-02 | 26-6400-01 | 26-6400-03 | 26-6400-10 | 26-6400-15 |
| Unmodified Oligonucleotides | $0.50 | $0.90 | $1.95 | $2.95 | $19.50 | $27.65 |
| Maximum Length of Synthesis | 80 mer | 120 mer | 200 mer | 250 mer | 250 mer | 250 mer |
凝膠純化
如果應(yīng)用將用于PCR或測序，則所有短于40 mer的Gene Link寡核苷酸都不需要進(jìn)一步純化。以99.5％的偶聯(lián)效率合成的20 mer寡核苷酸將包含?90％的全長20 mer和?10％的截短序列的混合物。隨著寡核苷酸長度的增加，即使在99.5％的偶聯(lián)效率下，全長寡核苷酸的產(chǎn)量也會(huì)降低。60 mer原油產(chǎn)品將包含?75％的全長寡核苷酸，同樣，100 mer將包含?60％。強(qiáng)烈建議對50 mer以上的寡核苷酸進(jìn)行純化。
| 產(chǎn)品 | 50 nmol規(guī)模 | 200 nmol規(guī)模 | 1 umol量表 | 2摩爾規(guī)模 | 10 umol量表 | 15 umol量表 |
| 貨號（PAGE） | 26-6400-77 | 26-6400-77 | 26-6400-55 | 26-6400-88 | 26-6400-44 | 26-6400-99 |
| 凝膠純化（PAGE） | 75.00 | 75.00 | 150.00 | 280.00 | 1500.00 | 1800.00 |
| 貨號（RPC） | 26-6400-11 | 26-6400-11 | 26-6400-22 | 26-6400-23 | 26-6400-33 | 26-6400-34 |
| 反相純化（RPC） | 30.00 | 30.00 | 90.00 | 170.00 | 750.00 | 900.00 |
| 原油脫鹽 | RPC純化** | 凝膠純化 | |||||||||||||
| 20 mer oligo 典型產(chǎn)量 | 30 mer oligo 典型產(chǎn)量 | 50 mer oligo 典型產(chǎn)量 | |||||||||||||
規(guī)模 | A 260伙 | 納摩爾 | 毫克 | A 260伙 | 納摩爾 | 毫克 | A 260伙 | 納摩爾 | 毫克 | ||||||
50納摩爾 | 8-10 | 30+ | 0.2-0.3 | 4-5 | 12+ | 0.1-0.16 | NR * [1-2] | NR * [2-4] | NR * [0.03-0.06] | ||||||
200納摩爾 | 20-25 | 80+ | 0.6-0.8 | 8-12 | 24+ | 0.26-0.4 | 4-6 | 8+ | 0.13-0.2 | ||||||
1 ü摩爾 | 100-120 | 400+ | 3-4 | 40-50 | 90+ | 1.3-1.6 | 20-25 | 40+ | 0.6-0.8 | ||||||
2 û摩爾 | 200-240 | 800+ | 6-8 | 80-100 | 180+ | 2.5-3.1 | 40-50 | 80+ | 1.2-1.5 | ||||||
10 ù摩爾 | ?1000 | ?4000 | ?30 | ?400 | ?900 | ?10 | ?200 | ?400 | ?60 | ||||||
15 ù摩爾 | ?1500 | ?6000 | ?45 | ?600 | ?1350 | ?15 | ?300 | ?600 | ?90 | ||||||
純度和產(chǎn)率 | 純度大于80％ 取決于寡核苷酸的序列和結(jié)構(gòu)。有關(guān)寡核苷酸長度相關(guān)的純度和產(chǎn)率，請參見偶聯(lián)效率表。 PCR和測序應(yīng)用無需進(jìn)一步純化。 凝膠純化建議用于50 mer以上的寡核苷酸以及涉及克隆和誘變的所有應(yīng)用。 ** RPC是使用藥筒進(jìn)行的反相純化；HPLC的替代品。 | 純度85％至95％ 取決于寡核苷酸序列和結(jié)構(gòu) GC含量高的序列的收率和純度會(huì)更低 不建議用于35 mer以上的寡核苷酸。 ** RPC是使用藥筒進(jìn)行的反相純化；HPLC的替代品。 | 純度98％至?100％ 取決于寡核苷酸序列和結(jié)構(gòu) 隨著寡核苷酸長度的增加，產(chǎn)量將逐漸降低。回文，發(fā)夾和高GC含量的寡核苷酸以及包含3個(gè)或更多G鏈的寡核苷酸會(huì)誘導(dǎo)強(qiáng)烈的二級結(jié)構(gòu)和堿基堆積，從而降低純度和產(chǎn)量。 *不推薦NR | ||||||||||||
*一個(gè)。表中列出的典型產(chǎn)量是未修飾的隨機(jī)序列寡核苷酸。使用高GC含量的寡核苷酸和形成強(qiáng)二級結(jié)構(gòu)的寡核苷酸可觀察到產(chǎn)量降低。 b。改性寡核苷酸預(yù)計(jì)產(chǎn)量會(huì)降低。減少百分比隨修改類型和站點(diǎn)數(shù)量而變化。每個(gè)修飾位點(diǎn)的典型減少量為10％-20％。 C。對于等摩爾的堿基組成，計(jì)算出的DNA寡核苷酸的產(chǎn)量為33µg / A260。單基或均聚物的長拉伸將具有可變的產(chǎn)率。均聚物20 mer的示例：dA（20）=?25ug / A260單位；dC（20）=?40ug / A260單位; dG（20）=?32ug / A260單位和dT（20）=?37 ug / A260單位 | |||||||||||||||
合成后修飾的共軛/轉(zhuǎn)化（NHS，硫醇，馬來酰亞胺等）的合成和產(chǎn)率規(guī)模
Most oligo modifications are directly coupled using optimized automated DNA synthesis protocols that are suited for specific modifications. The final yield varies and are usually around 80% of the yield of the unmodified oligos. Multiple modifications and sites in the same oligo may lead to further reduction in final yield.
Certain modification (e.g Alexa fluorescent dyes, digoxigenin, etc) are not available for direct autoamted coupling chemsitry and have to be conjugated using post synthesis methods involving amino group to NHS (N - hydroxysuccinimide) ester, thiols to maleimide and other post synthesis conversions.
這些合成后的共軛反應(yīng)動(dòng)力學(xué)可產(chǎn)生約60-85％的終產(chǎn)物，建議使用聚丙烯酰胺凝膠純化。這些合成后綴合的收率指南在下面列出。
| RPC純化** | 凝膠純化 | ||||||||||||||
| 20-40 mer oligo 典型產(chǎn)量 | 20-40 mer oligo 典型產(chǎn)量 | ||||||||||||||
規(guī)模 | A 260伙 | 納摩爾 | 毫克 | A 260伙 | 納摩爾 | 毫克 | |||||||||
50納摩爾 | ?2 | ?4 | ?0.06 | ?1 | ?2 | ?0.03 | |||||||||
200納摩爾 | ?4 | ?8 | ?0.12 | ?2.5 | ?5 | ?0.07 | |||||||||
1 ü摩爾 | ?12 | ?24 | ?0.36 | ?8 | ?16 | ?0.24 | |||||||||
2 û摩爾 | ?20 | ?40 | ?0.6 | ?15 | ?30 | ?0.45 | |||||||||
10 ù摩爾 | ?100 | ?200 | ?3.0 | ?75 | ?150 | ?2.25 | |||||||||
15 ù摩爾 | ?150 | ?300 | ?4.5 | ?112 | ?225 | ?3.36 | |||||||||
純度和產(chǎn)率 | 純度60％至80％ 取決于寡核苷酸序列和結(jié)構(gòu) GC含量高的序列的收率和純度會(huì)更低 不建議用于35 mer以上的寡核苷酸。 ** RPC是使用藥筒進(jìn)行的反相純化；HPLC的替代品。 | 純度85％至?98％ 取決于寡核苷酸序列和結(jié)構(gòu) 隨著寡核苷酸長度的增加，產(chǎn)量將逐漸降低。回文，發(fā)夾和高GC含量的寡核苷酸以及包含3個(gè)或更多G鏈的寡核苷酸會(huì)誘導(dǎo)強(qiáng)烈的二級結(jié)構(gòu)和堿基堆積，從而降低純度和產(chǎn)量。 *不推薦NR | |||||||||||||
*一個(gè)。使用高GC含量的寡核苷酸和形成強(qiáng)二級結(jié)構(gòu)的寡核苷酸可觀察到產(chǎn)量降低。 b。改性寡核苷酸預(yù)計(jì)產(chǎn)量會(huì)降低。減少百分比隨修改類型和站點(diǎn)數(shù)量而變化。每個(gè)修飾位點(diǎn)的典型減少量為10％-20％。 C。對于等摩爾的堿基組成，計(jì)算出的DNA寡核苷酸的產(chǎn)量為33µg / A260。單基或均聚物的長拉伸將具有可變的產(chǎn)率。均聚物20 mer的示例：dA（20）=?25ug / A260單位；dC（20）=?40ug / A260單位; dG（20）=?32ug / A260單位和dT（20）=?37 ug / A260單位 | |||||||||||||||
